Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms