Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms