Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC22CQ9BRL7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms