Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF8Q9BRL6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF8Q9BRL6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms