Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms