Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RHOXF2Q9BQY4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms