Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN18Q99952 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN18Q99952 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms