Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms