Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SORT1Q99523 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SORT1Q99523 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms