Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A9Q96Q91 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A9Q96Q91 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms