Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP4Q96PP9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms