Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RDH12Q96NR8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms