Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NSMCE2Q96MF7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms