Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM47Q96LD4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms