Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SGCZQ96LD1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms