Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR3Q96KR7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms