Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms