Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms