Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCC12Q96J65 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms