Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED3Q96IU2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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