Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPNQ96H22 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPNQ96H22 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms