Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms