Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms