Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHMTQ93088 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms