Protein–RNA interactions for Protein: Q92841

DDX17, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX17Q92841 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDX17Q92841 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX17Q92841 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX17Q92841 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX17Q92841 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX17Q92841 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX17Q92841 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX17Q92841 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX17Q92841 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX17Q92841 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX17Q92841 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX17Q92841 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX17Q92841 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms