Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF4BQ92750 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms