Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF3Q92576 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms