Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNAAF4Q8WXU2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms