Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms