Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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COPS9Q8WXC6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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COPS9Q8WXC6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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COPS9Q8WXC6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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