Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC4Q8WW27 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms