Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHDC4Q8TBB5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC4Q8TBB5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms