Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NUP35Q8NFH5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NUP35Q8NFH5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NUP35Q8NFH5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP35Q8NFH5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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