Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGBL3Q8NEM8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL3Q8NEM8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms