Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NGDNQ8NEJ9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NGDNQ8NEJ9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms