Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms