Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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