Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms