Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CLDN19Q8N6F1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms