Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms