Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC47Q8N1G4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms