Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms