Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPFIBP1Q86W92 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP1Q86W92 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms