Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9AQ7Z3C6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms