Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC29A4Q7RTT9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms