Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTF1AQ7RTS3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTF1AQ7RTS3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms