Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OTOP1Q7RTM1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms