Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms