Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP6Q6ZN66 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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GBP6Q6ZN66 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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GBP6Q6ZN66 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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GBP6Q6ZN66 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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GBP6Q6ZN66 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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GBP6Q6ZN66 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
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GBP6Q6ZN66 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBP6Q6ZN66 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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