Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms